Buenas Maquina.
El principal problema de lo que propones, es el tipo de valvula que has de utilizar para controlar el paso de vapor a cada camara.
Una solenoide normal no te vale, ya que el gran problema es que los generadores de vapor de electrodos, no crean la presion suficiente como para abrirlas, por lo que tendrias que ir a valvulas de bola de accionamiento neumatico o a algo parecido, y el coste de esto ya es bastante alto.
Respecto a lo del agua condensada en las lanzas de inyeccion de vapor, no has porque tener problema si haces la instalacion correctamente, esto es, colocar las tuberias de modo que desaguen hacia la bandeja o hacia el propio generador de vapor, de manera que no quede nunca agua en las tuberias cuando estas se enfrien y puedan condensar agua.
Respecto a la capacidad del humidificador, si por ejemplo usas un Pego, tienes la posibilidad de mediante entradas digitales, hacer una reduccion de potencia, de modo que puedas elegir la capacidad de produccion de vapor segun las necesidades que tengas y el que tengas que alimentar una sola camara o las 2. Es bastante facil de hacer.
Repecto al uso de humidificadores por aspersion, la verdad es que no me gustan. Mi experiencia con ellos es que dan muchisima guerra, pero para gusto los colores.
Asi, que visto lo visto, yo voto por montar 2 humidificadores, que es lo que menos te complicara la vida.
De todos modos, seria interesante que nos dijeras para que tipo de aplicacion necesitas montar los humidificadores, mas que nada por si vemos alguan " contraindicacion ".
Saludos